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  • 腔肠素(Coelenterazine)是在水生生物中发现的一种发光基团(luminophore),是许多荧光素酶的作用底物,包括海肾荧光素酶(Renilla reniformis luciferase, Rluc),分泌型膜锚定荧光素酶(Gaussia luciferase, Gluc)和薮枝虫荧光素酶(Obelia luciferase),和发光蛋白包括水母发光蛋白(Aequorin)的构成之一。其作用原理是以腔肠素为底物的荧光素酶,在含分子氧的条件下,氧化腔肠素产生高能量的中间产物,在此过程发射蓝色光,光波长在450~480nm。而甲虫(或萤火虫)荧光素/荧光素酶(FLuc)系统不同,其在含分子氧的条件下,还需要ATP和Mg2+的存在才能同时发光,光波长在550-570nm。正由于生物发光信号和底物的差异,RLuc常常与FLuc联合用于多重转录报告基因研究,或用作Fluc系统内萤火虫荧光素酶转染的内参。
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  • 花菁类染料(Cyanine Dyes)是一种在两个氮原子间含聚亚甲基桥键且携带一非定域电荷的分子。归其结构特征,花菁素具有极其高的消光系数通常高于100,000 L⋅mol-1⋅cm-1。不同的替代基允许控制发光团的性能比如吸光波长,光稳定性和荧光强度。例如,通过选择不同长度的聚亚甲基桥键能够控制吸光和荧光波长:花菁素越长,吸光和发射波长更高,高达至近红外区。